山东省中医药博物馆，由山东省中医药管理局于2015年3月批复成立，并于2017年开放试运行，2018年正式开放。博物馆坐落于长清大学路山东中医药大学校内，是集中医药历史文化实物、中药材标本和人体科学标本的展藏、研究、教育于一体的综合性博物馆，至今已接待参观团组共计70000余人次。

博物馆现有展区面积近9000平方米，其中独立单体位于大学南门扁鹊雕像东侧，椭圆形建筑，共四层，总建筑面积4617平方米，另有室外中草药种植园区“百草园”占地4000余平方米。博物馆馆藏医史文物1000余件，中药标本2000多种8千多瓶（份），室外药圃栽种中草药1000多种。

山东省中医药博物馆突出鲜明齐鲁中医药文化和实践特色，以“齐鲁文化和儒学”、“医宗扁鹊故里”、“针砭外治之源”三张齐鲁中医名片为核心，开辟有中医馆、中药馆、养生馆和人体生命科学馆等室内展区和科普互动区。

其中，一楼中医馆，设有齐鲁文化与中医学、医家之祖秦越人、异法方宜和针砭外治之源、汉画像石与生命文化、儒学与中医发展、上医国手刘惠民、齐鲁道地药材等10个展区，各展区主要展示具有山东特色的中医药历史文化相关实物史料。

二楼是中药馆，现开辟有中药标本生态园景观、中药起源与发展、全国道地药材、中药商品与市场文化、海洋药物、山东道地药材、中药蜡叶标本、中药炮制饮片、方剂组方、中成药、中药伪品、药用植物浸制标本、贵重中药标本等13个展区，和一个包括中药鉴定、中药炮制、腊叶标本制作的中药互动体验区。

三楼是校史馆、贝壳馆和内经养生馆。山东中医药大学校史馆包括学校概况、泽润杏林、岁月流金、耕耘化育、“八老”和国医大师等12个展区；贝壳馆收藏有精心选自世界各地、具有代表性的珍奇贝壳和珊瑚300多种2000多件。此外，还展有鲸鱼骨、海龟、玳瑁、砗磲等大型展品。内经养生馆讲养身之"道”，包括生气通天、法于阴阳、司岁备物、道法自然、起居有常、和调经脉、从容人事、谨和五味、恬淡虚无、形与神俱、德全不危等18个模块。

四楼是生命科学馆，设有生命之源、生命之美、生命之本、生命之光、生命之河、生命之惑和生命之脉共7个标本展区和一个交互活动区，有650余件标本，其中主要包括11件大型人体全身标本，以及大量器官和人体系统标本，病理和医疗操作展示的真实标本。

博物馆经过积极建设申报，获批成为“全国中医药文化宣传教育基地”“山东省第十一批社会科学普及教育基地”“山东省师德涵养基地”“山东省中医药健康旅游示范基地”“山东省科普教育基地”“济南市科普教育基地”“济南市思政课实践教学基地”“中华中医药学会科普基地”“全国先进中药标本馆”“济南市健康教育基地”等荣誉称号，作为学校的文化科普阵地，在提升学校知名度方面发挥了积极作用。